El hábitat mejor representado en el Paraje Natural de Sierra Helada son los pastizales anuales de Thero- Brachypodietea y los matorrales termófilos. Sin embargo, y por su especial relevancia, merecen ser destacados los relacionados con la duna fósil, dunas con vegetación esclerófila del Cisto-Lavanduletea y los matorrales halófilos que conforman una vegetación casi permanente.También son de importancia las comunidades de los acantilados con Limonium endémicos. En la zona aparece además como especie vegetal prioritaria la silene hifacensis ,sin perjuicio de otras especies de interés presentes en la zona como: asperula, dianensis, biscutella montana,teucrium hifacense o limonium parvibracteatum. Las formaciones de pino carrasco  (Pinus halepensis) representan el único testimonio actual de vegetación arbórea siendo los encinares una comunidad muy limitada a la parte culminal de la sierra. En el medio marino, aparecen como especialmente relevantes las mencionadas praderas de Posidonia y Cymodocea, aunque también deben destacarse otros hábitats como las cuevas marinas o los arrecifes

La fauna terrestre de mayor interés la constituyen las aves marinas, pudiendose considerar la zona como la segunda en importancia para este grupo de aves en la Comunidad Valenciana, tras el archipiélago de las Columbretes. La especies nidificantes de mayor interés son el paíño común  (Hydrobates pelagicus) y la gaviota de audouin  (Larus audouinii), aunque también son relevantes las rapaces como el halcón peregrino  (Falco peregrinus). Otras especies de interés que se pueden observar son el Cormorán moñudo (Phalacrocorax aristotelis), la pardela cenicienta (Calonectris diomedea) o la Pardela balear (Puffinus mauretanicus).